故事是發生在一個沙漠所環繞的大地，為這片大地的人民帶來滋潤的，是由雲朵之葉組成的神木「雨雲之樹」、以及及樹的主人「雨神．阿美芙拉絲」(音同降雨)。吉米是一位喜愛發明的青年，有天因為不註意而使弟妹被誤當成祭品送給雨神，於是為瞭追回親人爬上瞭雨雲之樹，卻在上面遇到瞭一名手持鞭子的粗暴少女蘇拉...而她就是住在這棵樹上的「雨神」。為瞭要回弟妹，吉米答應蘇拉製作可愛的洋娃娃給她，這也開始瞭兩人之間不解的緣份。但在某一天，有一位同是雨神．阿美芙拉絲的美麗女性－－希爾魯來到瞭蘇拉的雨雲之樹上，並且奪走瞭樹的心臟「核」...蘇拉因此失去瞭所有的神力，雨雲之樹也枯萎瞭。為瞭搶回被奪走的核，吉米和蘇拉、以及吉米的保護者達魯，三人前往其他有雨雲之樹的城鎮搜集情報、並找尋著希爾魯；然後，他們遇見瞭．阿美芙拉絲的長老，並也得知瞭希爾魯的位置。為瞭奪回「核」，一行人往希爾魯的樹前進......